福建医科大学附属第一医院是我省目前规模最大的集医疗、教学、科研于一体的专业技术人才高度密集的大型综合性三级甲等医院之一。医院创建于1937年，1993年被国家卫生部、世界卫生组织授予“爱婴医院”，1995年被国家卫生部评为福建省首批“三级甲等医院”，2001年成为福建医科大学第一临床医学院。2005年医院成建制接收福建炼化公司职工医院，并成立福建医科大学附属第一医院闽南分院。2011年初福建省皮肤病性病防治院和挂靠其内的福建省皮肤病性病防治研究所成建制整合并入我院，成立福建医科大学附属第一医院皮肤病性病分院。2014年医院践行国家倡导的“公办民营”理念，与福建省文澳投资管理有限公司共同合作创办福建医大附一康复医院和“医养结合”新型养老服务机构——福建医大附一护养中心。2016年闽南分院更名为闽南医院，并再开省属医院与县区级政府联合办医先河，整合闽南分院与泉港区医院，建立融合型“医联体”。
医院本部坐落在福州市中心乌山风景区南麓，核定床位2800张，职工总数3000多人，其中正、副高职称人员517人，医师中具有博士、硕士研究生学历的超过总数60%。现有国务院特殊津贴专家23人，国家卫计委（卫生部）有突出贡献中青年专家4人，国家万人计划百千万工程领军人才1人。年门诊量235万多人次、出院病人数8.7万多人次、年手术量近2万5千台。
医院科室齐全，实力雄厚。除闽南医院、皮肤病性病分院、康复医院外，还拥有临床、医技科室70个，建有院士专家工作站，设有健康体检中心和福建医大附一护养中心。其中，神经内科、整形外科、普通外科为国家临床重点专科建设项目单位，中西医结合心血管科为国家中医药管理局重点专科及福建省中医、中西医结合重点专科；神经内科、骨科、神经外科、整形外科、普通外科、眼科、耳鼻咽喉科、儿科、病理科、皮肤科为福建省临床重点专科建设项目；神经内科、耳鼻咽喉科为福建省医学重点学科；高血压、骨科专业为福建省医学领先特色专业；神经病学、高血压、腹部外科、耳鼻咽喉科、眼科专业被福建省科技厅定为优先发展学科。福建省神经病学研究所、福建省高血压研究所、福建省腹部外科研究所、福建省骨科研究所、福建省眼科研究所、福建省耳鼻咽喉研究所、福建省皮肤病性病防治研究所、福建省糖尿病研究院等8个省级研究所、院，福建省医学会16个专科分会、福建省中西医结合学会等16个省级医学专科分会，福建省麻醉质控中心、福建省重症医学质量控制中心、福建省脑卒中医疗质控中心、福建省人工关节置换质控中心、福建省临床用药质量控制中心、福建省核医学质控中心、福建省高血压病诊疗质控中心、福建省糖尿病治疗质控中心、福建省脊柱内镜诊疗质控中心、福建省神经认知与运动障碍质控中心、福建省癫痫治疗质控中心、福建省医疗美容质控中心12个省级医疗质控中心，福建医科大学17个研究室和5个福建医科大学临床医学重点学科挂靠我院；医院是国家药物临床试验机构、国家卫生计生委临床药师培训基地、国家卫生计生委临床药师师资培训基地、国家卫生计生委肝移植定点机构、国家卫生计生委化妆品不良反应鉴定机构、国家卫生计生委脑卒中筛查与防治基地、国家卫生计生委冠心病介入诊疗培训基地、国家卫生计生委内镜与微创医学骨科培训基地、国家卫生计生委内镜与微创医学耳鼻咽喉科培训基地、国家卫生计生委内镜与微创医学神经外科培训基地、国家卫生计生委外周血管介入诊疗培训基地、国家卫生计生委内镜与微创医学妇产科培训基地、国家卫生计生委内镜与微创医学泌尿外科培训基地、国家卫生计生委内镜与微创医学普外科培训基地；设有福建省华侨医疗服务中心、福建省儿童弱视斜视防治中心、福建省新生儿听力筛查诊断中心、福建省慢病（高血压）防治中心、福建省老年眼病视觉工程技术研究中心、福建省睡眠呼吸疾病诊疗中心，同时是首批省、市各类医疗保险和省司法厅亲权鉴定（亲子鉴定）的定点单位。医院承担国家级刊物——《中华高血压杂志》的编辑和出版工作。
医院拥有PET/CT、复合线路SPECT、640层螺旋CT、3.0T超导MRI、数字减影心血管造影装置（DSA）、多功能全数字化X光机、3D C臂移动X光机、高中能直线加速器、三维适形调强放射治疗系统、双能X线全身骨密度分析仪、体外震波碎石机、连续性肾脏替代治疗仪、准分子激光器、眼底及脉络膜荧光造影机、光学相干断层摄影仪（OCT）、各种高端听（视）觉检查设备、全自动细菌检测培养仪及高档生化仪、免疫分析仪流水装置系统、各种系列内窥镜、电子镜，彩色多普勒超声诊断仪、体外循环机、麻醉工作站、手术定位导航系统、超声刀、癫痫刀、神经电生理监测系统、第三代气压弹道超声碎石仪、生物波脱敏治疗仪、手术显微镜、超声胃镜、支气管镜等先进的仪器设备；拥有31间现代化的层流净化并配有数字一体化的手术室，带有层流净化、正负压的监护病房（ICU），以及大容量高压氧舱等。可开展大型、复杂手术及介入治疗，微创技术广泛并成熟应用于临床各个领域。
医院拥有临床博士后流动站，有一级学科博士学位授权点2个、二级学科博士学位授权点25个；一级学科硕士学位授权点7个、二级学科硕士学位授权点54个；有博士研究生导师29名、硕士研究生导师222名；有全国“住院医师心中的好老师”1名，福建省优秀教师3名、高等学校教学名师3名、师德标兵2名、杰出人民教师1名、优秀教育工作者1名。每年招收博、硕士研究生200余名；福建医科大学4个省级研究生教育创新基地挂靠我院。医院现有临床医学教研室（组）45个，临床教师1000余名，每年承担着福建医科大学临床医学、医学影像学、医学检验学、口腔医学、麻醉学、药学、护理学、眼视光学、康复医学、公共事业管理、社会工作等10余个专业1000余名学生的临床教学与管理工作；医院作为我省首批住院医师规范化培训基地，涵盖17个专业，承担全省住院医师规范化培训工作。2014年31个专业获批成为国家级住院医师规范化培训基地,每年招收培训对象近200名。2014年“医学生临床综合能力培养体系的建立与实践”获省级教学成果特等奖。2016年，在杰出教学团队的带领下，组织培训的临床医学生代表福建医科大学在第七届全国高等医学院校大学生临床技能竞赛中以全国第一名佳绩荣获特等奖。学院拥有近1000平方米临床医学培训中心，是美国心脏协会（AHA）授权的心血管急救培训中心，2013年成为全国大学生校外实践教学基地。配备无线智能模拟人Simman 3G、模拟仿真SIMoneTM分娩模型、综合穿刺训练电子标准化病人、多媒体心肺音听诊与腹触诊综合训练系统等国内外先进教学模具，承担多专业多层次临床技能培训及考核、继续医学教育学习班等工作，并按AHA标准开办BLS和ACLS培训班。学院与美国、澳大利亚、德国、荷兰、加拿大、芬兰、新西兰、日本等国家以及港台等地区开展广泛的学术交流，与省内30多家市、县级医院建立友好协作关系。
医院坚持科技兴院，成绩斐然。仅“十一五”以来，先后荣获国家科技进步二等奖、福建省科学技术奖等各级各类奖项74项；获得国家级自然基金、国家支撑计划课题等各级各类科研课题立项850多项。继2014年医院荣登中国医院科技影响力综合实力百强榜后，2015年、2016年连续两年荣登中国医院竞争力顶级医院排名百强榜。